Un des résultats essentiels du projet consiste en la mise en place du réseau de surveillance de la qualité des eaux du lac Tanganyika (Lake Tanganyika Water Monitoring Network). Le réseau de surveillance associera les laboratoires des pays riverains. Le projet financera leur mise en conformité et l’appui en équipements afin d’assurer un suivi des divers sites d’échantillonnage. Les données de suivi de la qualité alimenteront une base de données et un WebGis (Lake Tanganyika Water Portal) accessible à différents publics.